Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd1Q9CQA6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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