Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms