Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rnaseh2cQ9CQ18 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnaseh2cQ9CQ18 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnaseh2cQ9CQ18 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnaseh2cQ9CQ18 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Rnaseh2cQ9CQ18 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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