Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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