Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bhlhe41Q99PV5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bhlhe41Q99PV5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Bhlhe41Q99PV5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bhlhe41Q99PV5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bhlhe41Q99PV5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bhlhe41Q99PV5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bhlhe41Q99PV5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Bhlhe41Q99PV5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bhlhe41Q99PV5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bhlhe41Q99PV5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Bhlhe41Q99PV5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bhlhe41Q99PV5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms