Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80bQ99PT3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms