Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt23Q99PS0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt23Q99PS0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt23Q99PS0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt23Q99PS0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt23Q99PS0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt23Q99PS0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt23Q99PS0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt23Q99PS0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt23Q99PS0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt23Q99PS0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms