Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cep41Q99NF3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cep41Q99NF3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cep41Q99NF3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cep41Q99NF3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cep41Q99NF3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cep41Q99NF3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cep41Q99NF3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cep41Q99NF3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cep41Q99NF3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cep41Q99NF3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cep41Q99NF3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cep41Q99NF3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms