Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms