Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brms1Q99N20 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms