Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms