Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms