Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms