Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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