Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Cldn16Q925N4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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