Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rnf144aQ925F3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rnf144aQ925F3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rnf144aQ925F3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Rnf144aQ925F3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Rnf144aQ925F3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Rnf144aQ925F3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Rnf144aQ925F3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Rnf144aQ925F3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Rnf144aQ925F3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Rnf144aQ925F3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Rnf144aQ925F3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Rnf144aQ925F3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Rnf144aQ925F3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Rnf144aQ925F3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Rnf144aQ925F3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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