Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms