Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms