Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms