Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco4Q91WU4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms