Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms