Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Smg8Q8VE18 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Smg8Q8VE18 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Smg8Q8VE18 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Smg8Q8VE18 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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