Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgtbQ8VD33 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms