Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn4Q8VCH8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms