Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx2ipQ8VC66 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx2ipQ8VC66 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx2ipQ8VC66 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx2ipQ8VC66 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx2ipQ8VC66 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx2ipQ8VC66 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx2ipQ8VC66 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx2ipQ8VC66 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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