Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms