Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Rnf183Q8QZS5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Rnf183Q8QZS5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Rnf183Q8QZS5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Rnf183Q8QZS5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Rnf183Q8QZS5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rnf183Q8QZS5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rnf183Q8QZS5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rnf183Q8QZS5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rnf183Q8QZS5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms