Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms