Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms