Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6bQ8K2H2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms