Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Scara5Q8K299 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Scara5Q8K299 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Scara5Q8K299 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Scara5Q8K299 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Scara5Q8K299 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Scara5Q8K299 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scara5Q8K299 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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