Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms