Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c1Q8K193 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms