Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms