Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZK6

Trim61, MCG22896, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim61Q8JZK6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trim61Q8JZK6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trim61Q8JZK6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trim61Q8JZK6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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