Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LgsnQ8CIX8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms