Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI15

Sphk1, Sphingosine kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1Q8CI15 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sphk1Q8CI15 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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