Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Setd1bQ8CFT2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms