Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClasrpQ8CFC7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms