Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec10Q8CF98 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms