Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms