Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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