Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lrif1Q8CDD9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Lrif1Q8CDD9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lrif1Q8CDD9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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