Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms