Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CntrobQ8CB62 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms