Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms