Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9F4

Gm9949, Predicted gene 9949, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9949Q8C9F4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms