Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dclre1bQ8C7W7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms