Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmnQ8C5W0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmnQ8C5W0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms