Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms